Niels W. Gade (1817-1890) havde for længst slået sit navn fast som en af tidens førende komponister og dirigenter, da han i 1858 blev ansat som organist ved Holmens Kirke.
Skønt han fortsat var dirigent i Musikforeningen og i 1868 blev direktør ved det nyoprettede Københavns Musikkonservatorium, tog han ingenlunde let på kirketjenesten, men passede den omhyggeligt frem til sin dødsdag den 21. december 1890.
Niels W. Gade har komponeret utallige værker: kammermusik, 8 orkestersymfonier, balletter, kormusik m.v.
I Holmens Kirke har forskellige stykker musik af Gade vundet indpas ved årligt tilbagevendende begivenheder.
For eksempel synges den kendte "Morgensang" af Elverskud ("I østen stiger solen op") som introitus til konfirmationer, ligesom hans koralfantasi "Af højheden oprunden er" for orgel solo altid spilles som præludium ved gudstjenesten Juleaften, og motetten for dobbeltkor "Kristus er opstanden!" synges ved højmessen påskedag.
Mange af Niels W. Gades melodier til danske salmer og sange anvendes i dag. For eksempel: "Barn Jesus i en krybbe lå", "Udrust dig, helt fra Golgata", "Op, thi dagen nu frembryder", "Kirken er som Himmerige", og melodier til verslige sange: "På sjølunds fagre sletter" og "Grøn er vårens hæk"
Niels W. Gade's berømte værk for solosang og orgel "Kirkearien", der har tekst fra Davids psalme 130, blev komponeret på opfordring af operasangerinde ved Det Kgl. Teater, Louise Sahlgreen, til en koncert i Christiansborg Slotskirke i maj 1855.
Gade's kollega i Holmens Kirke, kantor Viggo Emil Bielefeldt, har kort tid efter Gades død nedfældet disse ord (Det kgl. Bibliotek/Holmens Kirkes Musikarkiv/Orgeljournal):
4de Søndag i Advent klang Orglet for sidste Gang under vor store Tonekunstners Hænder (sidste Psalme: "Fred til Nod for bittert Savn"). Han var da rask og livlig og i særlig godt Humør, 
samme Aften forlod hans ædle Sjæl det jordiske.
Niels W. Gade blev bisat fra Holmens Kirke. Det var familiens ønske at begravelsen foregik så enkelt som muligt: ingen udsmykning, ingen sørgeflor eller musik udover salmesangen, hvor der naturligvis blev sunget melodier af den afdøde. Alligevel blev det en helt særlig højtidelighed:
Længe før klokken 1, hvor bisættelsen skulle begynde, var kirken fyldt til sidste plads af repræsentanter for regeringen, Landstingets formand, Det Kgl. Teaters chef, Universitetets rektor og dekaner og mange flere. Især var naturligvis hele det københavnske musikliv kommet for at tage afsked med sin leder, repræsentanter for de forskellige musikforeninger og orkestre og Musikkonservatoriet, og sidst, men ikke mindst, ankom kongeparret Christian IX og Dronning Louise med stort følge.
Kisten, som var placeret ved opgangen til alteret var fuldstændig skjult af et hav af blomster, laurbær- og palmekrnase med bånd, og foran kisten var der lagt så mange kranse, at de nåede langt ned i kirken.
Bisættelsen blev forettet af Holmens provst Thomas Skat Rørdam.
I Holmens kirkes kapelgang findes Niels W. Gades fornemme marmorsarkofag, bekostet af foreningen "Niels W. Gades Minde". Over sarkofagen står indskriften:
Af Toner bygged Han sin Jacobsstige
Fra Jordens Mørke op til Lysets Rige,
I dem Hans Drøm fik Liv, Hans Tanke Vinger,
Og gjennem dem Hans Eftermæle klinger.